影片讲述了一个叫王葆的小孩的故事，王葆是一个喜爱幻想的小孩，但他是一个事事不顺，不喜爱学习的小孩。在一次钓鱼时，他竟然钓上了外婆在故事里讲的宝葫芦！在得到宝葫芦后发生了一连串妙趣横生、不可思议的故事。最后，尝到苦果的王葆把宝葫芦丢进了湖里，自己去训练自己。当他成功了，并且宝葫芦也离开的时候，他发现这只是一个梦……
《宝葫芦的秘密》不仅仅是一部喜剧电影，他还有一个大道理，这个道理在电影里已经点破：这个世界上没有不劳而获的道理。在看到宝葫芦将要离开王葆时，有的同学说：“给我！给我！走了干什么？！”这些同学我想都是懒惰的。你只有勤奋才能获得成功，除勤奋外，没有其他方法可以迈向成功。现在是2007年，已经是21世纪了，我们要做的就像是毛主席所说的：“好好学习，天天向上”，要成为国家的栋梁，而不能因鹤立鸡群缺少竞争对手而成为无用的人。
宝葫芦在哪儿？你无论翻山越岭走遍天涯海角也找不到。为什么？因为他就藏在你的身体里，也许有点难以置信，但事实就是这样，保护路的名字叫——勤奋！因为你勤奋，你才会得到你想要的东西；因为你勤奋，你才能取得100分；因为你勤奋，你才能摘得奖牌。勤奋的与否能操纵你的命运，控制你的命运，把我你的命运。
但在一些人眼里，“宝葫芦”就是爸爸妈妈。每一天都是衣来伸手，饭来张口，想要什么都可以信手拈来。这种人我们应该为他感到羞耻！雄鹰不经历风雨，怎么能见彩虹？花朵不经历风雪，怎么能傲放于大自然？快点结束这样的生活吧，这样下去你是不会成功的。
“三更灯火五更鸡，正是男儿读书时。”宝葫芦的秘密就是勤奋。朋友，你知道了吗？