在一片茂密的森林里，住着小石头一家人，小石头非常听话，经常帮助妈妈做很多事情，妈妈很爱他。
有一天，小石头住的这片森林沉了下去，小石头和他的一家人也都跟着沉了下去，小石头就在大海中渐渐地睡着了。
又过了一万年，海底上升了，小石头这才醒过来，他张大眼睛东张张西望望，发现自己坐在一座高山的顶上，小石头又发现自己的肚皮上融合着一条完整的小鱼骨头，小石头吓了一大跳，吃惊地说：“我的肚子上自怎么有一条鱼骨头？”这句话把正在沉睡着的石头妈妈吵醒了，小石头连忙说：“妈妈，瞧，我变样了！”妈妈说：“小东西，你找错妈妈了，回自己的家去吧。”小石头只能自己上学去了。
到了学校，小石头有好多同学的肚皮上也有这种图画，有贝壳、有小鱼、有海带、还有海螺呢！小石头又听到一阵嘲笑自己丑的话，他感到非常难过，小石头拿起一个包裹，背在身上出走了。
一天，他来到海边哭了起来，一只海豚浮到水面上问小石头：“小化石，你为什么哭了？”小石头说：“我不叫小化石，我是小石头。”海豚见小石头不知道自己是化石，又不想打扰他，就游走了。忽然，一个科学家走过来看了看小化石，就把小化石带回了家。
后来，小化石被送进了博物馆，成了供大家观赏的化石。
小化石虽然只能静静地躺在那儿，可是他想：能为科学作出贡献，这是一件快乐的事！
从此，小化石成了小朋友们最了解的化石。